Практически все осложнения в результате люмбальной пункции вызваны неправильным проведением данной процедуры. Нарушение техники может стать причиной возникновения постпункционной холестеатомы спинного мозга, которая связана с переносом в оболочки спинного мозга клеток эпителия. Среди других осложнений можно выделить различные инфекции, болевой синдром в течение нескольких дней после проведения процедуры, внутричерепная субдуральная, внутримозговая и субарахноидальная гематома. Также введение иглы может повредить корешки нервов, что приводит к образованиям грыжи диска из-за его травмирования. В том случае, когда в субарахноидальное пространство вводятся контрастные вещества, анестетики, воздух, химические препараты и антибактериальные, может возникать менингеальная реакция различной степени. Иногда она приводит к миелиту, арахноидиту, радикулиту. Среди самых незначительных и быстро проходящих осложнений можно выделить головную боль, рвоту, тошноту, головокружение, которые усиливаются в случае попытки больным подняться с постели. Что касается беременных женщин, то для них люмбальная пункция особо опасна. Ее проведение может спровоцировать выкидыш. Также могут развиваться вазовагальные реакции, которые опасны нарушением работы сердца, остановкой дыхания, а значит и гипоксией мозга.